彭博報導指出，巴基斯坦一度以一中政策為由，拒絕台灣航空公司進出其領空，之後又恢復通行。 行政院29日對此表達高度遺憾，認為相關作法衝擊飛安並將空域政治化。
行政院發言人李慧芝表示，巴方扈從中國、無視國際規範，行政院對此高度遺憾。 交通部表示會與業者保持聯繫並提供協助，報導也提到外交部先前對空域政治化的譴責立場。
報導指出，巴基斯坦起初僅允許中國籍航空公司飛越其領空，數小時後民航主管機關已核准中華航空與長榮航空於10月28日至明年3月27日期間使用其領空。 交通部與民航局表示會密切聯繫並提供必要協助、掌握航路動態，10月28日至明年3月27日屬冬季班表，航路每季申請、明年3月再申請夏季班表為國際常見做法。 李慧芝另提及國安與外交團隊已掌握訊息並會適當因應、尊重業者依安全、時間、成本選擇航路，外交部28日已嚴厲譴責並重申兩岸互不隸屬。